Основные направления научных исследований:
- разработка и совершенствование мер борьбы с заболеваниями общими для человека и животных, регистрируемыми в зоне Северного Кавказа;
- изучение малоизвестных и ранее не регистрируемых болезней сельскохозяйственных животных и птицы;
- создание и совершенствование новых высокоэффективных и экологически безопасных методов, средств, технологий и систем диагностики, профилактики и терапии болезней животных, обеспечивающих устойчивое ветеринарное благополучие и получение продукции животноводства высокого санитарного качества;
- координация научных исследований, проводимых ветеринарными научно-исследовательскими учреждениями зоны Северного Кавказа;
- научно-методическое руководство, диагностическая и практическая помощь товаропроизводителям АПК всех форм собственности Южного федерального округа Российской Федерации;
- фундаментальные и прикладные исследования по решению проблем ветеринарии, направленных на обеспечение эпизоотического благополучия животноводства Северного Кавказа.