Разработка программ развития рыбного хозяйства Белгородской области, содействие укреплению материально-технической базы членов Ассоциации, воспроизводство и рациональное использование водных биоресурсов, осуществление мер государственной поддержки организаций, входящих в систему Ассоциации.