ФГУ ФНЦ НИИСИ РАН выполняет теоретические исследования и практические разработки в области современных микропроцессоров, ЭВМ на их основе, а также базового и специализированного программного обеспечения.
В ФГУ ФНЦ НИИСИ РАН разработана отечественная аппаратно-программная платформа, которая обеспечивает создание высоконадежных сбоеустойчивых вычислительных систем петафлопсной, а период до 2020 года - экзафлопсной производительности.
В ФГУ ФНЦ НИИСИ РАН разработано семейство отечественных ЭВМ "Багет" различного назначения, которые широко применяются в современных серийно производимых комплексах вооружения.