ГВКГ им. Н.Н. Бурденко является головным многопрофильным специализированным лечебным учреждением и клинической базой для повышения квалификации медицинских работников медицинской службы Вооруженных Сил Российской Федерации.
Наряду с лечебно-диагностической деятельностью, госпиталь занимается научно-исследовательской работой, клиническими испытаниями новых лекарственных препаратов и медицинской техники, проведением научно-практических конференций различного уровня, издает научно-методические материалы.