Основными направлениями деятельности ФГУП "НТЦ "Атлас" являются:
Защита информации в ведомственных и корпоративных информационно-телекоммуникационных системах.
Разработка и изготовление защищенных сотовых телефонов.
Разработка средств криптографической защиты информации, средств защиты информации от несанкционированного доступа, защищенных операционных систем.
Проведение работ по созданию и обеспечению информационной безопасности Официальных Интернет-сайтов ОГВ РФ.
Защита электронного документооборота на базе сертифицированных программных платформ и средств.
Проведение работ по созданию современных защищенных и функциональных программных платформ и средств, сертифицированных по требованиям информационной безопасности.
Сопряжение разнокатегорированных сетей.
Производство интеллектуальных пластиковых карт с отечественным микропроцессором для удовлетворения потребностей государственных органов, банковских структур и коммерческих организаций, а также защиты интересов граждан РФ.
Разработка отечественных высокозащищенных голографических защитных знаков.
Разработка дизайна, изготовление и поставка голографических защитных элементов для защиты от подделки и копирования документов, ценных бумаг и изделий, а также для защиты от несанкционированного доступа помещений и оргтехники.