Водный кластер создан в апреле 2015 года при поддержке Правительства города Санкт-Петербурга. Кластер включает три сегмента: образовательный, технологический и промышленный. Координацию деятельности сегментов Кластера осуществляет АНО "УК Кластера водоснабжения и водоотведения в Санкт-Петербурге".
Цель Водного кластера - формирование условий для разработки и внедрения новых технологий в сфере водоснабжения и водоотведения на основе российских разработок.