Средняя общеобразовательная школа № 40 г. Томска была введена в эксплуатацию 1 сентября 1989 г., в 2010 году изменился статус школы, она стала автономным общеобразовательным учреждением.
На сегодняшний день МАОУ СОШ № 40 г. Томска является массовой общеобразовательной школой - 1786 учеников, 63 класса-комплекта, 102 педагога.
Школа имеет свою структуру управления, свои традиции, свои особенности, играет заметную роль в педагогическом сообществе города и области: является членом Ассоциации Лучших школ России, победителем конкурсного отбора общеобразовательных учреждений, внедряющих инновационные образовательные программы в рамках НП "Образование" в 2007 году, базовой площадкой областного института повышения квалификации работников образования, городского информационно-методического центра, Томского государственного педагогического университета, Томского областного педагогического колледжа.
В 2008 году школе присвоен статус регионального Ресурсно-внедренческого центра инноваций (РВЦИ).
По итогам работы в 2009 и в 2011 годах школа включалась в Национальный Реестр "Ведущие образовательные учреждения России".
В 2010 году школа одержала победу в конкурсном отборе на получение денежного поощрения образовательным учреждениям, внедряющим инновационные образовательные программы в Томской области; в 2011 году - стала победителем конкурсного отбора на получение денежного поощрения коллективам областных государственных и муниципальных образовательных учреждений Томской области, внедряющих инновационные образовательные программы (проекты), в номинации "Инновационные образовательные программы начального общего образования".
В 2012 году - школа победила в данном конкурсе по 2-м номинациям.
В школе работают 102 педагога, 73 % от всего педагогического состава аттестованы на квалификационные категории, 56 % учителей имеют отраслевые и правительственные награды, 5 педагогов - лауреаты Премии губернатора Томской области в сфере образования и науки, 8 учителей - лауреаты Премии города Томска в сфере образования, 3 педагога - победители ПНПО, 6 педагогов являются победителями Регионального конкурса на соискание денежного поощрения лучшим учителям за высокие достижения в педагогической деятельности, получившие общественное признание, 25 учителей являются обладателями стипендии Губернатора Томской области; 5 учителей по итогам Всероссийского конкурса "Мой лучший урок" награждены медалью "За службу образованию", ежегодно педагоги школы получают порядка 40 призовых мест в профессиональных конкурсах на разных уровнях.
Учителя школы систематически используют в своей педагогической деятельности современные технологии обучения, что позволяет добиваться высоких показателей качества образования в МАОУ СОШ № 40 г. Томска: по данным сравнительного рейтинга ОУ по количеству призовых мест Всероссийских олимпиад школьников с 1998 по 2012 год, подготовленным информационно-методическим центром г. Томска, МАОУ СОШ № 40 находится на 5 месте, так только в 2012 году обучающиеся школы получили 19 призовых мест на муниципальном этапе и 6 - на региональном.
Ежегодно школьная коллекция конкурсных трофеев и регалий прирастает в среднем на 600 разных наград, дипломов и грамот разного уровня и профиля.