Институт озероведения РАН проводит фундаментальные и прикладные исследования на озерах и других водных объектах и их водосборах.
Они направлены на разработку методов комплексного изучения озерных экосистем под воздействием природных и антропогенных факторов, восстановления водоемов, их использования для целей водоснабжения и рекреации, на решение проблем экологического мониторинга, управления режимом и ресурсами озер с целью рационального природопользования и решения социально-экономических задач.