Основными целями деятельности Института являются проведение фундаментальных и прикладных научных исследований, внедрение достижений науки и передового опыта, направленных на получение новых знаний в земледелии, мелиорации и водном хозяйстве, растениеводстве, выведении новых сортов сельскохозяйственных растений, способствующих развитию агропромышленного комплекса, реализация оригинальных семян. Всего селекционерами Института создано и передано в Государственное сортоиспытание свыше 100 сортов сельскохозяйственных культур. В настоящее время в Государственный реестр селекционных достижений, допущенных к использованию (на 29.12.2017), включено 64 сорта и гибрида сельскохозяйственных культур селекции Института.