Югорский государственный университет основан в октябре 2001 года по инициативе Правительства Ханты-Мансийского автономного округа - Югры Постановлением Правительства РФ от 20.08.2001 г. по приказу Министерства образования РФ N3916 от 5.10.2001 г., лицензия на образовательную деятельность N7159 от 08.06.2006 г.
В настоящее время Югорский государственный университет, созданный на базе работавших ранее в Ханты-Мансийске филиалов:
Всероссийской государственной налоговой академии,
Нижневартовского государственного педагогического института,
Сибирской автомобильно-дорожной академии,
Томского государственного университета систем управления и радиоэлектроники,
Тюменской государственной сельскохозяйственной академии,
является одним из самых молодых государственных вузов России.
Особая заслуга по созданию университета принадлежит Губернатору Ханты-Мансийского автономного округа - Югры Александру Филипенко. Под его руководством была проведена планомерная, долгая и кропотливая работа, в результате которой 20 августа 2001 года премьер-министром Российской Федерации было подписано распоряжение о создании в Ханты-Мансийске государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования "Югорский государственный университет".
Мы доказали, что округ может являться местом для проживания, а не только территорией для временного пребывания рабочей силы,- сказал Александр Филипенко, - население округа нуждается в образовательных услугах, и эффективнее подготовка специалистов будет проходить на месте, что в свою очередь предупредит опасность миграции талантливой молодежи".
Важнейшей областью деятельности ЮГУ является подготовка кадров для промышленного сектора экономики.