Департамент здравоохранения Воронежской области является исполнительным органом государственной власти Воронежской области, обеспечивающим разработку и реализацию государственной политики в сферах здравоохранения и обращения лекарственных средств на территории Воронежской области.
В структуре исполнительных органов государственной власти Воронежской области Департамент входит в социальный блок.
Департамент в своей деятельности руководствуется Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, федеральными законами, указами и распоряжениями Президента Российской Федерации, иными нормативными правовыми актами органов государственной власти Российской Федерации, Уставом Воронежской области, законами Воронежской области, указами губернатора Воронежской области, иными нормативными правовыми актами органов государственной власти Воронежской области, а также настоящим Положением.
Департамент является правопреемником департамента здравоохранения и социального развития Воронежской области по переданным функциям в сферах здравоохранения и обращения лекарственных средств, в том числе и по обязательствам, возникшим в результате исполнения судебных решений.
Департамент является юридическим лицом, имеет собственные бланки, штампы, печать с изображением герба Воронежской области, имеет самостоятельный баланс и смету, лицевые счета, открытые управлением федерального казначейства по Воронежской области, валютный счёт, открытый в установленном порядке, может от своего имени приобретать и осуществлять имущественные и неимущественные права, нести обязанности, выступать истцом, ответчиком, третьим лицом и заинтересованным лицом в судах.
Финансирование расходов, связанных с обеспечением исполнения полномочий, возложенных на Департамент, осуществляется за счёт средств областного бюджета, предусматриваемых на финансирование исполнительных органов государственной власти Воронежской области, а также за счёт средств в виде субвенций из федерального бюджета на осуществление переданных полномочий в соответствии с федеральным законодательством.