Союз координирует деятельность 158 хозяйств, объединенных в 11 региональных союзов. Из общего количества 75 расположены в районах Крайнего Севера, из них 35 являются национальными. Рыболовецкие хозяйства расположены на побережьях Охотского, Берингова, Баренцева, Белого морей и в низовье Волги.
Рыболовецкие колхозы имеют на балансе 1520 промысловых судов различных классов и назначений - от малого прибрежного рыболовецкого флота до супертраулеров океанического промысла, береговую инфраструктуру для обслуживания флота и рыбообрабатывающее производство.
Рыболовецкие колхозы добывают около одного миллиона тонн рыбы и морепродуктов, что составляет 25% от общероссийского улова.
Основные объекты промысла - минтай, треска, сельдь, лососевые, ракообразные.
Многие колхозы являются многоотраслевыми, кроме рыбного промысла и переработки гидробионтов занимаются сельским хозяйством, производством товаров широкого потребления, подсобными промыслами.
Ассортимент изготавливаемой продукции - мороженая, соленая, копченая, вяленая рыба, икра частиковых, лососевых и осетровых рыб, консервы и пресервы, морепродукты.
Предприятия системы модернизируют производство, наращивают производственные мощности, ориентируясь на улучшение качества рыбопродукции. К 2005 году ее выпуск будет доведен до 360 000 тонн.