Комплексное изучение водных промысловых животных, растений и среды их обитания; разработка рекомендаций по эффективному использованию, сохранению и воспроизводству водных биоресурсов; разработка биологических основ и биотехнологий промышленного культивирования морских организмов -объектов мари- и аквакультуры, биотехнологий воспроизводства лососевых и осетровых видов рыб; акклиматизация ценных объектов промысла; освоение новых безотходных технологий переработки уловов; разработка законодательных и нормативных актов в области рыболовства. Подготовка высококвалифицированных специалистов в аспирантуре и докторантуре.