Структура Института Физической Химии РАН состоит из 43 лабораторий, распределенных по основным направлениям исследований: коллоидно-поверхностные явления и адсорбционные процессы; физикохимия нано- и супрамолекулярных систем; радиохимия и радиационная химия; физико-химические проблемы коррозии, электрохимии, защитных покрытий и кристаллизации.
ИФХ также обладает Центром коллективного пользования физическими методами исследования с 8 отделениями.
Научно-образовательным центром и коррозийными станциями для натурных климатических испытаний в Москве, Звени городе, Мурманске, Владивостоке.