ТГМА осуществляет учебную, научную и лечебно-профилактическую деятельность на 6 факультетах: лечебном, стоматологическом, педиатрическом, фармацевтическом, факультете высшего сестринского образования и факультете последипломного образования, на 62 кафедрах.
В академии имеется специализированный Учёный Совет для защиты кандидатских диссертаций по специальностям: кардиология, хирургия, стоматология.
Эффективно работает научно-исследовательский центр.