В состав Новосибирской областной клинической больницы входят 35 лечебных отделений, объединённых в специализированные клиники, а также лечебно-диагностические подразделения, консультативно-диагностическая поликлиника на 700 посещений в смену и отделение экстренной и плановой консультативной помощи с телемедицинским центром.
Ежегодно в больнице получают специализированную медпомощь около 40 тыс. пациентов.
В больнице выполняется более 26 тыс. оперативных вмешательств в год, до 20 % из которых относятся к ВМП: трансплантация почки и печени, коррекция врожденных пороков развития у детей и др.