Центр является органом управления Министерства РФ по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий и предназначен для обеспечения управления и координации территориальных федеральных органов исполнительной власти, органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации и органов местного самоуправления в области гражданской обороны, защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера, а также обеспечения готовности к применению органов управления, специально уполномоченных для решения задач в области гражданской обороны, защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций, соединений и воинских частей войск гражданской обороны, организаций и поисково-спасательных формирований МЧС России на территории Северо-Западного региона Российской Федерации.
В состав регионального центра входят территориальные органы управления субъектов РФ в СЗФО, войска гражданской обороны, поисково-спасательная и Государственная противопожарная службы, Государственная инспекция по маломерным судам.