Институт проводит фундаментальные и приоритетные прикладные научные исследования по эпизоотологии заразных болезней птиц и разработке средств диагностики, терапии и их специфической профилактики; поиск методов и средств борьбы с кормовыми микотоксикозами и микозами.
Институт осуществляет производство, апробацию и внедрение новых или усовершенствованных биологических и химических препаратов. Оказывает научно-консультативную и практическую помощь птицехозяйствам России и стран СНГ. Готовит научные кадры и ведет пропаганду достижений ветеринарной науки и передового опыта.
Институт проводит координацию научных исследований в РФ и СНГ по проблеме "Ветеринарная профилактика в промышленном птицеводстве".