ФГБНУ ЦЭЭРБ осуществляет проведение фундаментальных и прикладных научных исследований по созданию технологий для ускоренного воспроизводства высокопродуктивных групп и пород крупного рогатого скота, разработке научно обоснованных и безопасных способов получения генно-инженерно-модифицированных организмов, разработке и совершенствованию технологий изготовления биологических препаратов и диагностикумов, разработке и совершенствованию технологий прогнозирования пола животных, разработке методов криоконсервации эмбрионов.