ФГБУ "ИБМХ" РАМН проводит исследования по следующим основным направлениями:
- Протеомные исследования и масс-спектрометрия;
- Персонализированная медицина;
- Нанолекарства;
- Биоинформатика;
- Биохимия и медицинская химия.
Индекс Хирша Института по РИНЦ равен 30. Институт является учебно-исследовательской базой для студентов Медико-биологического факультета Российского национального исследовательского медицинского университета имени Н.И. Пирогова.
На базе Института издается журнал "Биомедицинская химия".