Основными направлениями деятельности института являются:
разработка научных основ формирования систем земледелия нового поколения на ландшафтной основе, обеспечивающих высокую продуктивность земельных угодий и экологическую устойчивость (безопасность) территории;
разработка систем управления плодородием почв и получения экологически безопасной продукции в различных почвенно-климатических зонах России;
изучение причин, масштабов и последствий эрозии почвенного покрова Российской Федерации, изыскание новых эффективных средств борьбы с ней;
разработка теоретических принципов и вариантов формирования высокопродуктивных экологически сбалансированных агроландшафтов с использованием контурной организации территории;
-разработка энергосберегающих почвозащитных технологий возделывания сельскохозяйственных культур и технических средств для их осуществления;
разработка теоретических принципов и технологических основ биологизаиии земледелия;
разработка и совершенствование методов ведения научных исследований по вопросам земледелия и защиты почв от эрозии.