В Оренбургском государственном медицинском университете проводится обучение по семи основным образовательным программам специалитета и бакалавриата: лечебное дело, педиатрия, медико-профилактическое дело, стоматология, фармация, клиническая психология, сестринское дело.
Большое значение в вузе уделяется развитию инновационной деятельности среди молодежи. Студенческое научное общество имени Ф.М. Лазаренко объединяет студентов, участвующих в научно-исследовательской и научно-организационной работе.
СНО сотрудничает с научными обществами вузов России и стран ближнего и дальнего зарубежья. В вузе работает более 50 научных кружков, в которых занимаются более 1000 студентов.
Управление по воспитательной, социальной работе и связям с общественностью ОрГМУ работает с Ассоциацией общественных объединений студентов, в состав которой входит: добровольческое движение студентов, трудовые отряды, Совет трех общежитий, студенческий спортивный клуб "Авиценна", культурно-творческие коллективы и КВН движение, клуб молодого избирателя, Совет по качеству образования.
В Университете имеется собственная клиника, в которой на протяжении ряда лет активно ведется работа по амбулаторной профилактике и реабилитации.
В ОрГМУ реализуются программы дополнительного образования для подготовки к поступлению в вуз. Курсы работают по очной форме с различной продолжительностью. Набор на курсы осуществляется с 15 августа текущего года и продолжается в течение года.