НИИ Скорой помощи является современным многопрофильным стационаром. В его составе 20 клинических отделений всех основных профилей: хирургия печени и желчевыводящих путей, поджелудочной железы, сосудов, нейрохирургия, урология, гинекология, ортопедия, онкология, кардиология, неврология. Имеет 7 городских центров: сочетанной травмы, неотложной кардиологии, токсикологии, термических поражений, кровотечений и сосудистой хирургии, панкреатологический, анестезиологии и реанимации. Все диагностические службы работают ежедневно и круглосуточно, включая компьютерную томографию, эндоскопию, лапароскопию, УЗИ. Осуществляет последипломное обучение по кардиологии, хирургии, травматологии, анестезиологии, терапии.