Министерство сельского хозяйства Республики Башкортостан координирует деятельность более 900 сельскохозяйственных организаций, более 1000 предприятий пищевой и перерабатывающей промышленности, более 5000 крестьянских (фермерских) хозяйств и индивидуальных предпринимателей, более 590000 личных подсобных хозяйств.
Сельское хозяйство региона зерново-животноводческого направления, развиты коневодство и пчеловодство.